还不会数据挖掘？超详细课程附代码，一次性搞定

在这个人人都在写生信，人人都在冲SCI的年代，可以说不会数据挖掘的医生就不是一个合格的科研er。


对于从事肿瘤研究的临床医生或基础科研人员来说，从公共数据库中挖掘数据撰写并发表SCI可以说是最省时省力的办法了。今天就给大家介绍几个公用的数据吧！


TCGA（癌症基因组图谱）数据库包括常见癌症的基因组、转录组、蛋白组、表观遗传组数据和与其关联的临床数据，为挖掘有意义的组学变化和发现肿瘤发生、发展、转移等生物学机制提供了海量数据。


GEO是当今最大、最全面的公共基因表达数据资源。适合研究方向：基本包括所有疾病，不是做肿瘤的小伙伴可以选这个。难易程度：数据下载，整理都比较简单，分析过程需要R编程，这里有点难度，总的来说难度一般。发文的高度：只做纯GEO数据挖掘的文章一般只能1-2分的文章，适用文章的分数偏低。


Oncomine拥有最全的癌症突变谱、基因表达数据以及相关的临床信息，可用于发现新的生物标记物或新的治疗靶点。Oncomine 整合了GEO、TCGA和已发表的文献来源的RNA和DNA-seq数据。通过Oncomine，可以进行差异表达分析，共表达分析，查找某种癌症中差异表达的基因，确定目的基因，确定研究方向。


今天小燕子给大家带来了超详细数据挖掘教程，包含有视频课程还有代码哦，大家一起来学习吧~


领取方式请见文末~

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Oncomine还能打开吗？

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